Крути засновані зусиллями ніжинських міщан напередодні 1648 року. Власне два села — Крути і Кагарлики — розділені річкою Остер, виникли на землі, відведеної місту Ніжину за королівським актом 1624. Після Визвольної війни 1648—1657 років Богдан Хмельницький підтвердив права Ніжинського магістрату на це село. За часів Гетьманщини село входило до Ніжинського полку.
В селі Крути була церква (ще одна окрема в селі Кагарлики), церковно-приходська школа, близько 500 дворів.
На території Крутівської сільської ради розташовані три хутори: Бакланово, Діброва (колишні Твані), Поляна (колишні Хвостики), з’явились вони у 1907—1912 роках. За три кілометри від села Крути землями володів Глібовський, який жив у селі Переяслівці.
У селі Крути в листопаді 1905 року, під час Революції 1905—1907 років, було велике заворушення селян, які виступали проти російської влади. Були розгромлені крамниці євреїв — Іцька Гдаліна та Лейби Богатирьова. Лідерами загонів були козаки Горлач Іван Іванович, Горбач Ісаак Нестерович, Опанасенко Семен Федорович. Останній відбував тюремне ув’язнення в місті Козельці.
В даний час Крути — центр Крутівської сільради, до складу села також входять села: Бакланове, Поляна (раніше Хвостики), Діброва (раніше Твані).
У Крутах знаходиться селекційно-дослідна станція «Маяк», за якою закріплені сільськогосподарські угіддя й орні землі. Господарство спеціалізується на вирощуванні насіння овочевих культур.
У селі є середня школа, будинок культури з залом, бібліотека, лікарня, дитячий садок, будинок побуту, їдальня, магазини, відділення зв’язку, ощадкаса і Церква Архангела Михаїла, яку раніше зруйнували комуністи.
Наприкінці 2020 року була заснована об”єднана тероторіальна громада (ОТГ) центром якої стали Крути. Крутівська об’єднана територіальна громада сьогодні — це 6 сільських рад, що включають 14 сіл Ніжинського р-ну. Загальна площа ОТГ — 291, 4 км, чисельність населення 3651 особа.
